昆明市西山区碧鸡医院成立于2008年9月，其前身是碧鸡卫生院医疗部。碧鸡卫生院创建于1973年，是一所集医疗、预防、保健、康复、健康教育、计划生育工作为一体的国家非营利性医疗机构。根据昆发【2008】5号《中共昆明市委市人民政府关于进一步加快民营医院发展的实施意见》文件精神，结合碧鸡医院卫生现状，在各级部门的关心、支持、帮助下，通过引进社会资金、人才，改善医院软硬件设施等方式对卫生院进行了医疗试点改革，按照“医防分设”要求，成立了西山区碧鸡医院。
碧鸡医院转型近五年时间，立足于区、乡、村三级卫生防保网的重要枢纽，坚持以“定位一级医疗机构，实施二级医院经营管理、技术水平、医疗设备及服务质量”作为长期发展目标，承担着辖区内4万多人民群众的初级医疗、防疫、保健工作。医院在软硬件建设方面的投入几乎等于重建了一个医院，医疗收入翻了近三番，以优异业绩实现“医防分设”的完美转型。
医院现有职工86人，其中医技人员66人，高级职称3人，中级职称12人。开设床位80张，开设急诊科、内科、外科、妇科、康复理疗科、中医科、口腔科、肛肠科、临床检验中心（放射、超声影像、检验、心电图）、手术室、人流室、妇科治疗室等综合性临床科室。配备有GE彩色超声诊断仪、红外线乳腺扫描诊断仪、电子阴道镜、十二导心电图机、心电监护仪、全自动血生化分析仪、全自动血球计数仪、尿液分析仪、德国美创血凝仪、电解质分析仪、LEEP刀、多源频谱治疗仪、全自动洗胃机、多功能麻醉机、新生儿辐式抢救台等医疗设备，可开展阑尾切除术、胆囊摘除术、剖腹产、疝修补术、顺产接生、子宫全切、卵巢囊肿切除、计划生育手术、宫颈糜烂、宫颈息肉利普刀治疗等各类手术，能够较好地满足辖区人民群众的诊疗需求。
2012年，医院立足实际，着眼全省乃至全国，高瞻远瞩，坚持以“高起点规划、高标准设计、高质量建设”的目标，积极抢抓机遇，不断开拓进取，根据云南省“十二五”规划，结合西山区“十二五”招商引资实际，积极引进民间资本，定位于打造一所“大专科、小综合”的高品质老年病医院，力求解决当前日益凸显的老龄化问题，同时解决辖区以及周边的就医需求。
目前，医院已经取得新项目建设所需的25.13亩土地，用于云南省卫生厅批复的三级综合医院建设。相关规划、环评、建设等工作正在稳步推进，新项目战略规划、科室设置、组织建设、薪酬体系和人才队伍建设 工作正积极推进，项目预计于2014年建成并投入使用。此外，医院科研教育中心、“托老、护老”关爱中心等项目的相关工作正在陆续推进。
